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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  34 lines
  1. ************************
  2. * TEA domain signature *
  3. ************************
  4.  
  5. The TEA domain [1] is a DNA-binding region of about 66 to 68 amino acids which
  6. has been found in the N-terminal section of  the  following nuclear regulatory
  7. proteins:
  8.  
  9.  - Mammalian enhancer factor TEF-1. TEF-1 can bind to two  distinct  sequences
  10.    in the SV40 enhancer and is a transcriptional activator.
  11.  - Drosophila scalloped protein (gene sd),  a  probable  transcription  factor
  12.    that functions in the regulation  of cell-specific gene  expression  during
  13.    Drosophila development, particularly  in the differentiation of the nervous
  14.    system [2].
  15.  - Emericella nidulans  regulatory  protein  abaA.  AbaA  is  involved  in the
  16.    regulation  of conidiation (asexual spore);  its expression  leads  to  the
  17.    cessation of vegetative growth.
  18.  - Yeast trans-acting factor TEC1.  TEC1  is involved in the activation of the
  19.    Ty1 retrotransposon.
  20.  
  21. As a signature pattern, we have used positions 39 to 67 of the TEA domain.
  22.  
  23. -Consensus pattern: G-R-N-E-L-I-x(2)-Y-I-x(3)-T-x(3)-R-T-[RK](2)-Q-[LIVM]-S-S-
  24.                     H-[LIVM]-Q-V
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27. -Last update: October 1993 / Text revised.
  28.  
  29. [ 1] Buerglin T.R.
  30.      Cell 66:11-12(1991).
  31. [ 2] Campbell S.D., Inamdar M., Rodrigues V., Raghavan V., Palazzolo M.,
  32.      Chovnick A.
  33.      Genes Dev. 6:367-379(1992).
  34.